fantom_zona’s diary

Impact the world!!!

2019-02-01から1ヶ月間の記事一覧

deepchem.models.sequentialではグラフ構造を読み取れなかった話

注意 この記事を読んでも特に得るものはありません。ただdeepchem2.1.0ではsequentialにグラフ畳み込みが出来なかったというだけの話です。 概要 deepchem 2.1.0 python2.7 model=deepchem.models.Sequential() """ model.fit() → model._create_graph(self,…

deepchemのインストールについてのメモ

deepchemで遊んでいるうちに環境を壊してしまい、改めてインストールすることになりました。なのですが、これまでpython3系で動いていたはずなのにうまく行きません。deepchemのWebページでは3系でインストールできるみたいな雰囲気をかましているので、メモ…

化合物-タンパク質相互作用の予測器を動かしてみた

はじめに この論文を読んでみました。githubにコードが落ちていたのでcolaboratory上で動かしてみました。 colabでの環境構築 rdkitを入れなくてはいけないのでやむなくminicondaを入れました。 conda-forgeから入れるとこのバグは生じませんでした。 !wget …