fantom_zona’s diary

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2022-12-01から1ヶ月間の記事一覧

RNA描画ツールRNAcloudを作ってみた話

この記事はkyoto.bioinfoアドベントカレンダーの企画でお送りしております. adventar.org TL;DR 低分子集団をいい感じにプロットするmolcloudを改変して,RNAcloudという描画ツール作ってみた. RNAcloudで君だけのRNAを描画しよう!!(molcloudのオプショ…

bioanalyzerのファイルパーサーを作った話

これはkyoto.bioinfoアドベントカレンダーの記事です. adventar.org TL;DR bioanalyzerの結果を可視化するためのpythonスクリプト(PyBioAnalyzer)を書いた. github.com 追記・編集履歴 pipで使えるようにしてみました.初めてsetup.py書きました.*1 そ…

『タンパク質構造とトポロジー』読書記録①

最近データ解析に使えるかと思って共立出版から出ている『タンパク質構造とトポロジー』を読んでいるのでその超簡単なログ. データ点の幾何的構造を抽出するためのパーシステントホモロジーという道具のための本. 数学に触れたのがかなり久しぶりのため,…